"Русский переплет" зарегистрирован как СМИ.
Свидетельство о регистрации в Министерстве печати РФ: Эл. #77-4362 от
5 февраля 2001 года. При полном или частичном использовании
материалов ссылка на www.pereplet.ru обязательна.
|
13.08.2014 14:12 |
Комар из Антарктиды урезал свой геном для выживания во льдах
Геном Belgica antarctica - крупнейшего истинно сухопутного животного Антарктиды - оказался самым маленьким среди насекомых. Ученые считают, что благодаря такому урезанию . . . |
13.08.2014 14:09 |
Конопля заставила ученых изменить взгляд на материал для суперконденсаторов
Канадские инженеры выяснили, что волокна конопли не уступают графену по своей способности накапливать электроэнергию. Ученые предложили изготавливать . . . |
13.08.2014 13:42 |
Филдсовскую премию впервые получила женщина
Филдсовскую премию, самую престижную награду в математике (ее сравнивают с Нобелевской премией), впервые за 78-летнюю историю получила женщина. Об этом сообщают BBC . . . |
12.08.2014 19:31 |
EMC поможет российским ученым разработать новые способы диагностики рака Центр исследований и разработок ЕМС, подразделение корпорации EMC, подписал соглашение о сотрудничестве с Академическим университетом Российской академии наук. Со стороны АУ РАН договор подписан ректором университета, академиком, нобелевским лауреатом Жоресом Алферовым. Как сообщили CNews в ЕМС, цель соглашения - объединить усилия по созданию легкой и удобной в использовании облачной платформы, применимой в клинической медицине для анализа геномных данных. Разработка поможет выявлять так называемые <гибридные гены>, которые в большинстве случаев являются причинами возникновения злокачественных опухолей. Помимо прочих задач, их обнаружение поможет упростить диагностику онкологических заболеваний.
В основе решения - разрабатываемые специалистами лаборатории алгоритмической биологии АУ РАН программные продукты SPAdes и Quast. SPAdes - это геномный ассемблер, созданный под руководством Павла Певзнера, одного из ведущих мировых ученых, занимающихся проблемами биоинформатики и вычислительной биологии. rnaSPAdes собирает воедино разрозненные данные, полученные после успешных РНК-секвенирований, произведенных на наиболее популярных сегодня платформах Illumina и IonTorrent. Качество транскриптомных сборок, создаваемых rnaSPAdes, должно быть сравнимо с результатами, получаемыми из наиболее продвинутых РНК-сборщиков. Ожидается, что rnaSPAdes будет управляться через командную строку, а значит как сама программа, так и проводимый ею полный процесс обработки будут удобны для практического применения, рассказали в EMC.
В свою очередь, Quast (<Кваст>) - это программный инструмент, с помощью которого будет производиться оценка качества создаваемых ассемблерами транскриптомных сборок и их сравнение. При этом Quast сможет работать как при наличии референсного генома (уже известного генома, близкого к анализируемому), так и без него. Планируется, что данные оценки можно будет представить в виде наглядных таблиц с характеристиками каждой сборки, а также графически отобразить их сравнение.
Центр исследований и разработок EMC фокусируется на подготовке облачной инфраструктуры для хранения генетических данных и выполнении биоинформатических вычислений для их правильного и качественного анализа.
Соглашение между организациями вступило в силу 1 июля. Со стороны Академического университета проектом руководит Алла Лапидус, заместитель директора лаборатории алгоритмической биологии Академического университета РАН.
<Мы надеемся, что наш совместный проект найдет самое широкое применения, - заявил Камиль Исаев, генеральный директор Центра разработок и исследований EMC в <Сколково>. - Многие онкологические заболевания обладают высоким уровнем смертности. Наша платформа поможет предупредить развитие заболевания, определив его наличие на ранних стадиях. Своевременно поставленные диагнозы в будущем спасут множество жизней. Наши партнеры по проекту из лаборатории алгоритмической биологии - ведущие специалисты своей отрасли. Мы рады сотрудничать с ними и, со своей стороны, будем использовать весь багаж накопленного EMC опыта, чтобы вместе добиться успеха>.
<В результате мы хотим получить полноценное решение, которое поможет значительно облегчить диагностику онкологических заболеваний, - добавила со своей стороны Алла Лапидус. - Исследование рака на ранней стадии - это рынок с огромной капитализацией. Создание понятного продукта с удобным интерфейсом, который, к тому же, обладает высокой производительностью, позволит использовать эту разработку на коммерческих платформах, где каждый сэкономленный час представляет ценность. Наше сотрудничество с Центром исследований и разработок компании EMC позволяет воплотить эти замыслы в полном объеме>.
|
12.08.2014 19:27 |
Ученые объяснили связь между финансами и арестами
Израильские социологи и экономисты построили модель, позволяющую оценить, как передача тюрем от министерства внутренних дел в ведение специального ведомства . . . |
12.08.2014 16:30 |
США предложили Индии совместную разработку электромагнитной катапульты
США предложили Индии принять участие в десяти проектах разработки и совместного производства, включая создание электромагнитной катапульты для авианесущих . . . |
12.08.2014 16:25 |
Компьютер научился предсказывать остановку сердца раньше врачей
Американские исследователи создали алгоритм, рассчитывающий вероятность остановки сердца и дыхания у пациентов клиник на основе данных их истории болезни, . . . |
12.08.2014 14:55 |
Китайские физики объяснили ударопрочность головы дятлов
Китайские физики выяснили, почему голова дятла обладает такими мощными противоударными свойствами. Секрет прочности черепа птицы - распределение и . . . |
12.08.2014 14:51 |
Лазеры и углеродные нанотрубки: новое слово в исследовании мозга
Как сообщает 3DNews, для исследования мозга используются самые различные инструменты и технологии. Никого сегодня не удивишь компьютерной, позитронно-эмиссионной . . . |
12.08.2014 14:49 |
В MIT создали прозрачную поверхность с <ресничками>, отталкивающими воду
Учёные из Массачусетского технологического института (MIT) представили свою очередную инновационную разработку - микроскопические <волосоподобные> структуры, . . . |
12.08.2014 14:27 |
Ученые создают модули Wi-Fi, которым не нужно питанием
Инженеры из Университета Вашингтона работают над новой технологией, которая называется . Ее суть заключается в том, чтобы позволить Wi-Fi модулям в смартфонах, . . . |
12.08.2014 14:23 |
Создано платье, способное выдержать миллион вольт
Искусство требует жертв. Модельеры идут на все, чтобы привлечь к своему творчеству внимание. В этот раз отличилась дизайнер Anouk Wipprecht из Нидерландов. Создано . . . |
12.08.2014 14:12 |
Россия построит лунную базу
В Роскосмосе разработан проект Федеральной космической программы на 2016 - 2025 гг., предусматривающий создание элементов лунной базы и специальной техники, которая . . . |
12.08.2014 14:10 |
АНБ США профинансирует объединение языков программирования
Агентство национальной безопасности США профинансирует проект американского Университета Карнеги-Меллон по объединению языков программирования. Цель проекта - . . . |
12.08.2014 14:07 |
В Китае откроется международный университет на базе МГУ
В понедельник был подписан договор о создании в Китае Международного университета на базе МГУ имени Ломоносова, сообщил проректор МГУ Сергей Шахрай. Шахрай . . . |
12.08.2014 14:05 |
Жители Земли стали свидетелями суперлуния
В минувшую ночь естественный спутник приблизился к нашей планете на максимально близкое расстояние В ночь с воскресенья на понедельник, 11 августа, расстояние от . . . |
12.08.2014 14:03 |
Молодая миллиардерша сделала состояние на крови
Элизабет Холмс ворвалась в мир богатейших людей мира с состоянием в 4,5 миллиарда долларов Благодаря изобретениям в сфере биотехнологий тридцатилетней Элизабет . . . |
12.08.2014 13:55 |
Черепах научили пользоваться тачскринами
Международный коллектив ученых научил четырех угольных черепах (Geochelone carbonaria) пользоваться тачскринами, сообщается в журнале Behavioral Processes (кратко об исследовании . . . |
12.08.2014 13:45 |
Создана самая быстрая фотокамера в мире
Ученые из Японии и США создали самую быструю фотокамеру в мире. Результаты своего исследования авторы опубликовали в журнале Nature Photonics. Новая камера способна, по . . . |
12.08.2014 10:57 |
Подробности о новейшей микроархитектуре Intel и 14-нанометровом производственном процессе
Intel опубликовала информацию о новой микроархитектуре, оптимизированной с помощью передового 14-нанометрового производственного процесса. Новые технологии . . . |