Родился 29 сентября 1947 года в г.Тбилиси.
Окончил Грузинский институт физической культуры.
Стихи Сергея Алиханова печатались и печатаются в журналах "Новый мир", "Знамя", "Юность", "Мы", "Москва", "Наш современник", в американском "Новом журнале", в израильском журнале "22", в альманахах "Поэзия", "День поэзии", в газетах "МК", "Новая газета", "Неделя" и др. Вышли книги стихов Сергея Алиханова: "Голубиный шум" ("Советский писатель", 1980 год), "Долгая осень", стихи и стихотворные переводы ("Мерани", 1987 год), "Лен лежит" ("Советский писатель", 1989 год), "Блаженство бега", однотомник ("Известия", 1992 год). Автор повести “Клубничное время” (“Континент”, № 77) и романа “Гон” (М., 2000).
На слова Сергея Алиханова написаны сотни эстрадных песен и вышло множество пластинок, компакт-дисков и кассетных альбомов. Песня на его слова «Ты должна рядом быть» признана лучшей песней 2005 года. Песня «Воздушные замки» - лауреат премии «Песня года 2006 года». Его песни исполняют Юрий Антонов, Игорь Иванов, Николай Караченцов, Ирина Уварова, Михаил Муромов, Юрий Антонов, ВИА «Синяя птица», Дима Билан, Кристина Аглинц и другие известные артисты. Одна из наиболее известных их совместных работ — песня композитора Романа Майорова «Что тебе подарить?».
Впоследствии на самостоятельные стихи Алиханова были написаны сотни эстрадных песен и вышло множество пластинок, компакт-дисков и кассетных альбомов. Он сотрудничал со многими известными композиторами, в числе которых Юрий Антонов, Владимир Шаинский, Олег Сорокин, Роман Майоров, Марклен Беленко, Владимир Евзеров, Олег Иванов, Руслан Горобец, Максим Дунаевский, Игорь Крутой, Ирина Грибулина, Елена Суржикова, Владимир Густов.
С 1988 года — член Союза писателей СССР и член Литфонда России, член Международного Содружества Писательских Союзов, член Союза писателей России, член песенной комиссии Союза Композиторов России.
В 2001 году Сергей Алиханов избран академиком Российской Академии Естественных наук. Является вице-президентом отделения литературы РАЕН. За роман «Оленька, Живчик и туз» в 2005 году был награжден медалью М.Ю. Лермонтова. Живёт и работает в Москве.
Творчеству Сергея Алиханова канал РТР (студия «Лад») посвятил часовой фильм, который неоднократно показывался по центральным каналам. Стихи Сергея Алиханова вошли в поэтические антологии ХХ века — «Строфы века-1» и «Строфы века-2», переведены на иностранные языки.
В "Русском переплете" опубликовал: